MCU我没用过，但可以在SD协议上给你一些思路。

使用了多块写，不等于发了命令之后就可以一直往里面写了，它有一个busy状态，这个状态会通过data0线来体现。
在正常情况下，data0线是拉高的，当传输完一个block之后，data0线会拉低一段时间，当它再次拉高时，表示可以继续往里写数据。
对于正版的卡，在首次传输完一个block即512字节时，data0线会拉低1ms左右的时间(实测了四种厂家的卡，包括闪迪、东芝、三星，速度为class10，数值仅供参考)。
在你传输完数据之后，你要发送结束命令,CMD12，收到正确回应之后表示这一次传输结束。
但是这个时候你还要注意一个地方，在结束传输之后，SD卡不会立马从prgmstate退出，这个时候如果你使用CMD7命令，SD卡将无法响应，从而产生错误，可能导致你接下来的所有对SD卡的操作失效。
要查询SD卡是否从prgmstate退出，可以通过CMD13命令，这个命令是用来查询SD卡当前的状态。

到目前为止也使用过几种MCU的SDIO控制器，基本上它们的DMA都有自动判断DAT0是否处于忙状态的功能，所以可能是你的命令设置上出了一些问题。