加密的目的是不让别人获取程序代码，或者获取了也不能使用。
很少像你说的，把代码加密后存入FLASH，然后CPU读取FLASH解密再放到RAM中运行。

加密的基本方式又两种，一是硬件加密，二是软件加密。
硬件加密：一般是烧断熔丝，或者锁死FLASH(TI的FLASH型DSP用这种)，目的都是防止别人读取程序代码。
软件加密：一般是ID加密，或者使用专用芯片加密。软件加密的程序，别人即使读到了FLASH中的代码，复制到其他板子上，也是不能正常工作的。