JTAG就是这样有点难搞的，你的系统是win几的？
首先你的仿真驱动有没有安装好？
下面是驱动，解压后你选择一个安装，不同系统有不同的驱动
驱动程序.zip (7.17 MB, 下载次数: 3)
还是不行的话，看看你软件安装时有没有勾选这个：

还有注意仿真是com端口的选择。端口选择必须是1~4端口。超出则会出问题改好记得重启

如果以上方法都没问题就升级一下仿真器的固件，方法如下：
将仿真器插入电脑，如果原来是插入的请拔下后重新插入，因为在插入的前 10 秒，
也就是仿真器红灯闪烁期间，要完成升级固件的连接，如果此期间连接未成功，需重新
插入仿真器，再执行连接操作；
在仿真器插入电脑的红灯闪烁期间内，点击软件的 TOOL—AVR PROG

软件会自动连接仿真器，进入固件升级界面，如下左图，如果连接不成功并弹出如下右
图的提示，只有两个原因会影响，一是不是在红灯闪烁期间点击的命令重新来过即可，
二是 COM 号不是在 COM4 以内，请参考前面介绍的更改 COM 号：
打开升级界面中的 Browse…加载升级文件
升级文件在你安装studio的安装位置那里
安装文件夹/Atmel/avr tool/jtagdce
点击下左图中 Flash 项下的 Program
升级完固件后，重新拔掉仿真器再插入，即可作以后的正常使用了.