改动如下：
//timer.c
u8 TimeOverFlag=0;

void TIM3_IRQHandler(void)   //TIM3中断
{
        if (TIM_GetITStatus(TIM3, TIM_IT_Update) != RESET)  //检查TIM3更新中断发生与否
                {
                TIM_ClearITPendingBit(TIM3, TIM_IT_Update  );  //清除TIMx更新中断标志
                LED1=!LED1;
                TimeOverFlag=1;
                }
}
//timer.h
extern u8 TimeOverFlag;
//usart.c
void USART1_IRQHandler(void)                        //串口1中断服务程序
{
        u8 Res=0;
        if(USART_GetITStatus(USART1, USART_IT_RXNE) != RESET)  
                {
                        TIM3_Int_Init(4999,7199);//500ms
                        Res =USART_ReceiveData(USART1);
                        USART_ClearITPendingBit(USART1,USART_IT_RXNE); //清除中断标志.
                        USART_RX_BUF[USART_RX_STA++]=Res ;
                }               
}
//mian
int main(void)
{               

        delay_init();                     //延时函数初始化          
        NVIC_Configuration();          //设置NVIC中断分组2:2位抢占优先级，2位响应优先级
        uart_init(9600);         //串口初始化为9600
        //LED_Init();                             //LED端口初始化
        //TIM3_Int_Init(4999,7199);//10Khz的计数频率，计数到5000为500ms  
  while(1)
        {
                if(TimeOverFlag==1)                 
                {
                        TimeOverFlag=0;
                        TIM_Cmd(TIM3, DISABLE);
                        for(t=0;t<USART_RX_STA;t++)
                        {
                                USART_SendData(USART1, USART_RX_BUF[t]);//向串口1发送数据
                                while(USART_GetFlagStatus(USART1,USART_FLAG_TC)!=SET);//等待发送结束
                        }
                        USART_RX_STA=0;
                }               
        }         
}

在中断里加入初始化函数，这样好么