稳压控制的是占空比，是频繁的开关动作，充电控制的只是机子的一次性投切，
通常，只是稳压器的负载才会并联电容，那么，占空比就受控于电容电压的涨落，沉重的脉冲性负荷会使负载电压的变化超出控制所需的范围，这或会使电路的开关动作暂时甚至永远停顿。

请问，C44 与 C45 跟那些 LED 如何连接？
如果直连，是闪不了的，若有开关(单片机控制)，那 LED 是咋灭的，是被开关掐灭的，还是电容吐尽了储能而熄灭的？

你那电路的供电是24V，对不，负载是否只有 R36和R38 而没其他？
如果是的话，当负载电压回升到5V时，若buck动作仍不停止，那两个电阻也许不足以把过剩的充电疏导掉，C44与C45 的电压恐会继续上升。